Разработка агонистов рецепторов с улучшенной фармакокинетикой путем прививки макроциклических пептидов в кристаллизующиеся фрагменты областей.

Блог

ДомДом / Блог / Разработка агонистов рецепторов с улучшенной фармакокинетикой путем прививки макроциклических пептидов в кристаллизующиеся фрагменты областей.

Jan 03, 2024

Разработка агонистов рецепторов с улучшенной фармакокинетикой путем прививки макроциклических пептидов в кристаллизующиеся фрагменты областей.

Природная биомедицинская инженерия

Nature Biomedical Engineering, том 7, страницы 164–176 (2023 г.) Процитировать эту статью

6603 Доступа

2 цитаты

444 Альтметрика

Подробности о метриках

Короткий период полураспада в кровообращении и плохой транспорт через гематоэнцефалический барьер ограничивают полезность цитокинов и факторов роста, действующих в качестве агонистов рецепторов. Здесь мы показываем, что агонисты суррогатных рецепторов с более длительным периодом полураспада в кровообращении и повышенной скоростью транспорта через гематоэнцефалический барьер могут быть получены путем генетической вставки фармакофоров макроциклических пептидов в структурные петли фрагмента кристаллизующейся (Fc) области человеческого иммуноглобулина. Мы использовали такой подход «лассо-прививки», который сохраняет уровни экспрессии области Fc и ее сродство к неонатальному рецептору Fc, для создания белковых каркасов на основе Fc с макроциклическими пептидами, связывающимися с рецепторной тирозиновой протеинкиназой Met. Агонисты Met димеризовали Met, вызывая биологические реакции, аналогичные тем, которые индуцируются его природным лигандом. Кроме того, лассо-прививка Fc-области мышиного антитела против рецептора трансферрина с Met-связывающими макроциклическими пептидами усиливала накопление полученных Met-агонистов в паренхиме головного мозга мышей. Прививка лассо может позволить создать дизайнерские белковые терапевтические средства с повышенной стабильностью и фармакокинетикой.

Клиническое использование цитокинов и факторов роста в качестве терапевтических средств было одобрено Управлением по контролю за продуктами и лекарствами США1,2, а их потенциальное применение в новых областях, таких как нейрогенез и восстановление мозга3,4, является предметом интенсивных исследований. Однако присущие им структурные свойства затрудняют их разработку для улучшения физико-химической стабильности и фармакокинетики, в частности, для лучшего периода полураспада или проникновения через гематоэнцефалический барьер (ГЭБ). Существующие методы, которые контролируют фармакокинетику белковых терапевтических средств, включают конъюгацию и слияние поли(этиленгликоля) с фрагментом кристаллизующейся (Fc) области иммуноглобулина5,6,7 для продления периода их полураспада; и слияние с Fab антитела против рецептора трансферрина (TfR) для усиления их проникновения через ГЭБ8,9,10. Однако степень, в которой эти методы могут улучшить фармакокинетику белков без негативного влияния на их биоактивность, зависит от свойств каждого белка5,6,7,8. Чтобы преодолеть присущие цитокинам и факторам роста структурные ограничения, был достигнут прогресс в разработке суррогатных агонистов, которые структурно не связаны с нативными лигандами11,12. Несмотря на эти недавние достижения, остается большая неудовлетворенная потребность в более надежных и универсальных методах разработки белковых терапевтических средств с желаемой физико-химической стабильностью и фармакокинетикой.

Макроциклические пептиды стали новым многообещающим классом кандидатов в лекарственные средства, обладающим рядом желательных свойств, таких как аффинность и специфичность связывания, подобные антителам13,14, способность нацеливаться на уникальные химические пространства15,16,17,18 и эффективное открытие посредством как рационального /Вычислительный дизайн и дисплей in vitro18,19,20,21. В целом макроциклические пептиды проявляют большее сродство к мишеням, чем линейные пептиды, из-за их ограниченной циклической структуры. Интригующей возможностью расширения применимости этих макроциклических пептидов является их «приживление» на белковые каркасы, позволяющие создавать функциональные комбинации пептида и белка18,22,23,24,25,26. Однако прививка пептидов, идентифицированных de novo, к петлям белка является сложной задачей из-за потенциального неправильного сворачивания как привитого пептида, так и белка-хозяина26.

Разработка системы RaPID (обнаружение случайных нестандартных пептидов), которая объединяет отображение информационной РНК и перепрограммирование генетического кода, позволила открыть циклизованные макроциклические пептиды на основе тиоэфиров с исключительной специфичностью связывания против белков-мишеней16,17,18. В предыдущих исследованиях мы показали, что фармакофорные последовательности, полученные из RaPID, можно легко имплантировать в открытые на поверхности петли белков и поддерживать как функции гостевого пептида, так и белка-хозяина, что мы назвали «лассо-прививкой»27,28,29 . Наблюдаемая исключительная совместимость при прививке, вероятно, обусловлена ​​внутренним свойством фармакофорных мотивов самосворачиваться в конформацию, связывающуюся с мишенью, подобную родительскому макроциклу, даже в контексте несвязанной петлевой структуры каркасных белков18,30.

 B1 > B2, which correlated well with their ability to activate cellular Met. The BS3-crosslinked 2:1 complex of MetECD and Fc(aMD4)B3 was purified by size exclusion chromatography (Extended Data Fig. 5c) and subjected to single-molecule examination by high-speed atomic force microscopy (HS-AFM)42, with Fc and MetECD as controls (Fig. 3c–f and Supplementary Videos 1–4). On HS-AFM, MetECD showed a globular Sema domain and Ig-like, plexins, transcription factors (IPT) stalk domains, with the relative positioning of each IPT domain being flexible (Fig. 3d and Supplementary Video 2). Fc(aMD4)B3 bound to the lower face of the Sema domain and bridged two Met molecules while having the IPT stalk domains sprayed away (Fig. 3e and Supplementary Video 3) or attached (Fig. 3f and Supplementary Video 4). The flexibility of IPT domains probably allows for the proper association of the intracellular kinase domains of two Met molecules, this association being essential for Met activation33,34. These results show that while Fc(aMD4)B3 binds to Met on a site different from that in HGF, its recruitment of two Met receptors in close proximity enables it to activate Met to the same extent as HGF./p>12 weeks, 19–24 g) given a single tail-vein injection or subcutaneous injection at 5.0 mg kg−1 for Fc(aMD4)B3, diluted in 100 µl PBS. Blood was drawn from the submandibular vein using a Goldenrod animal lancet (Bio Research Center) or from the orbital plexus at each time point, processed to serum and stored at −80 °C until analysis. The serum concentrations of Fc and Fc(aMD4)B3 were determined using a human immunoglobulin recognition immunoassay (human IgG ELISA quantitation set, Bethyl Laboratories). The serum concentrations of HGF were determined using an in-house developed ELISA. All animal experimental procedures were conducted in accordance with the guidelines provided by the Proper Conduct of Animal Experiments (1 June 2006, Science Council of Japan). The procedures were approved by the Institutional Review Board of Kanazawa University or the Laboratory Animal Ethics Committee of PhoenixBio./p>12 weeks, 15–21 g) were given a single subcutaneous injection at 5 mg kg−1 for Fc(aMD4)B3 in 200 µl PBS or control PBS. Forty-four hours after administration of Fc(aMD4)B3 or control PBS, 5-bromo-2'-deoxyuridine (BrdU) (Sigma Chemical) was intraperitoneally injected into chimeric mice at a dose of 100 mg kg−1 for 2 h before killing. Livers isolated from PXB-mice were treated with RNAlater for RNA-seq or prepared for BrdU staining. Formalin-fixed paraffin sections of chimeric livers were incubated with a rat anti-BrdU antibody at 3 µg ml−1 (Abcam, ab6326), followed by an Alexa Fluor 488-conjugated anti-rat IgG goat polyclonal antibody at 1 µg ml−1 (Abcam, ab150157). Nuclei were counterstained with 4′,6-diamidino-2-phenylindole (DAPI, Thermo Fisher) at 300 nM. Fluorescent images were obtained using Keyence BZ-X810. The number of BrdU-positive nuclei was determined by counting at least 15,000 cells in 20 randomly selected visual fields in sections from the lateral left lobe and medial right lobe per animal. The procedures involving humanized liver tissues were approved by the Utilization of Human Tissue Ethical Committee of PhoenixBio. All animal experimental procedures were conducted in accordance with the guidelines provided by the Proper Conduct of Animal Experiments (1 June 2006, Science Council of Japan). The procedures were approved by the Laboratory Animal Ethics Committee of PhoenixBio./p>